Tag-arkiv: Region Hovedstaden

Postdoc in virome analysis

If you have experience with comparative microbial genomics, annotation of viral genomes, classification of proteins and genes or analysis of metagenome data, then you could be exactly what we’re looking for.    In recent years we have begun to understand the important role of the human microbiome in protecting us from chronic disease. In this project, we want to understand whether the same holds true for viruses. Are most viruses good viruses that protect us from disease instead of causing it?   

Copenhagen Prospective Studies on Asthma in Childhood (COPSAC) is an internationally renowned research group consisting of approx. 40 employees all dedicated to revealing the causes of childhood asthma, allergy and eczema, as well as other chronic diseases in children. We have extensive data from the children on the many aspects of these diseases including symptoms, but also their general health, their genetics, epigenetics, metabolomics and immunological profiles.   

Viromes have been deeply sequenced from 700 children. We have 4 GB of virus data per child. We need to gain an overview of all of the different viruses in that data so we can compare them to the symptoms of the children, and figure out which viruses are good and bad. Most of the viruses are bacteriophages which infect the bacteria on the bodies of the children. We already have microbiome data for the same children and we need to find out which bacteriophages infect which bacteria.   

A major challenge in viromics is that most viruses are unknown and there’s no marker gene like 16S rDNA which can reveal their presence or which family they belong to. We need some way of distinguishing random DNA from viral DNA in our data, and we would like to officially classify any unknown viruses into new viral families so they can become known to science.   

As a Postdoc at COPSAC you will: 

  • Join the microbiome group and contribute with the analysis of our complex clinical and microbiological data
  • Get the opportunity to create your own research profile based on your experience and interests
  • Join a highly qualified team of postdocs, research assistants and clinicians
  • Get the comprehensive support of a large administrative team of data managers, IT support, and fundraising
  • Be part of a well-functioning and inspiring workplace with a sincere and fun atmosphere
  • Get loads of opportunities for bouncing ideas off colleagues and seeking advice

Your profile: 

  • You have a PhD or equivalent experience, preferably within microbiology or bioinformatics
  • You master coding and are used to data analysis on the Linux command line, or in R
  • You have experience within metagenomics, comparative genomics, virus bioinformatics or protein clustering
  • You have a good understanding of how microbiological systems work and evolve
  • You are curious and passionate and would like to be in the front line, where research makes a difference
  • You’d like to join a team and help support the group, but are also comfortable working independently, exploring own ideas

  COPSAC is part of GC-HSP and Professor Hans Bisgaard leads the Clinical Academic Group (CAG) entitled “Modulating the Infant Microbiome for Disease Prevention”. GCHSP is a new initiative to facilitate translational collaboration between basic scientists at University of Copenhagen and clinical researchers at the hospitals in Greater Copenhagen.     

Help make a difference 
You will play a crucial role as a postdoc in a highly interdisciplinary research environment, which publishes scientific articles in the highest-ranking international journals. We have strong ambitions with plenty of space for sparring and professional development. You will work within a team of colleagues who are all passionate about their work and proud of their achievements. The research group is in the limelight, internationally, and the research topic enjoys great public interest. We have an amazing transnational and informal working environment, characterized by a pleasant atmosphere.    

Are you interested? 
If you want to know more about the position, please contact Shiraz Shah (Tel no. +45 38 67 36 32, mobile +45 26 17 16 50) or Marianne Mikkelsen (+45 38 67 41 63) or read more about the research centre at: www.copsac.com   

Application deadline is 31st of March, 2019. Salary and employment will be by agreement and according to current rules in the Capital Region of Denmark. 

Apply

Read the job description at the university homepage

Post expires on Sunday March 31st, 2019

Postdoc søges til Sundhedsfremmeforskning på Steno Diabetes Center Copenhagen

Vil du være med til at udvikle og afprøve nye tilgange til at øge livskvaliteten hos voksne med diabetes? – og har du lyst til at igangsætte, lede og indgå i forskningsprojekter om udvikling, afprøvning og implementering af nye værktøjer og metoder med fokus på psykosocial støtte til voksne med diabetes?      

Steno Diabetes Center Copenhagen søger en postdoc-forsker til forskningsgruppen Diabetes Management i sundhedsfremmeforskningen inden for psykosocial sundhed og støtte til voksne med diabetes. Vi forventer tiltrædelse 1. juni 2019 eller snarest muligt.      

Om afdelingen og forskningsgruppen  
I Diabetes Management Forskning udvikler vi ny viden, metoder og tilgange til patient- og relations-fokuseret diabetesbehandling med brugerinvolvering, psykosocial støtte og patientuddannelse. Vi integrerer sundheds-, social- og psykologisk forskning for at skabe nye tilgange, og arbejder systematisk med komplekse interventioner fra udvikling til implementering for at skabe lokalt forankrede og bæredygtige tiltag.    

Forskningsgruppen består af ca. 20 videnskabelige medarbejdere samt studentermedhjælpere, studerende og praktikanter. Tilsammen repræsenterer vi et bredt fagligt område fx folkesundhedsvidenskab, sociologi, psykologi, pædagogik, kommunikation og antropologi.      

Stillingen  
Stillingen er forankret i teamet, som arbejder med psykosocial sundhed og støtte til voksne med diabetes. Dine opgaver vil primært bestå i egen forskning med både igangværende og nye projekter og med forpligtelse til at publicere og forestå videnskabelig formidling. Desuden vil du skulle deltage i det tværfaglige samarbejde samt forestå dataindsamling, analysere data og skrive artikler og ansøgninger.    

Der vil også indgå vejledning af studerende på forskellige niveauer samt ledelse af egen forskning og støtte i relation til yngre kollegers forskning.   

Du kommer til at referere til Teamleder, Forsker Lene Eide Joensen.    

Din profil  

  • Du har en ph.d.-grad samt postdoc-kvalificering inden for et relevant fagområde – fx psykologi, sociologi, antropologi eller folkesundsvidenskab.
  • Du har erfaring med tværfaglig interventionsforskning, gerne med fokus på psykosocial støtte og brugercentrering og gerne i relation til diabetes.
  • Du har erfaring med forskningsintegreret udvikling af metoder, der understøtter sundhedsprofessionelle til i en brugerinvolverende proces at give psykosocial støtte til personer med diabetes.
  • Du har faglig og menneskelig modenhed og kan arbejde både selvstændigt og i et tæt samarbejde i en tværfaglig gruppe. 
  • Du mestrer til fulde dansk og engelsk i tale og skrift. 

Løn og ansættelsesvilkår  
Ansættelsen er treårig og vil ske i henhold til gældende overenskomst med Regionen.

Information  
Hvis du vil vide mere om stillingen, er du velkommen til at kontakte Teamleder Lene Eide Joensen 30 91 32 93 eller Forskningsleder Ingrid Willaing tlf. 30 91 34 03.    

Ansøgning  
Din motiverede ansøgning, på dansk eller engelsk skal indeholde: kort motivation og baggrund for at søge stillingen (max 1 side), CV, publikationsliste, pasfoto, dokumentation for kvalifikationer og uddannelser og to relevante videnskabelige artikler, som du har skrevet. Ansøgningsfristen er den 7. april 2019.     

Om Steno Diabetes Center Copenhagen  
Steno Diabetes Center Copenhagen (SDCC) er et internationalt førende diabeteshospital forankret i Region Hovedstaden. Hospitalet har specialiseret sig i behandling, klinisk forskning, forebyggelse og uddannelse i diabetes. SDCC er Skandinaviens største diabeteshospital, der har tilknyttet omkring 9.000 personer med diabetes. Læs mere på www.sdcc.dk og følg os på Facebook, Twitter og LinkedIn. 

Post expires on Sunday April 7th, 2019